致力于骨代谢疾病（颈腰椎疾病、骨与关节病、老年性骨病、 骨肿瘤等）、老年多脏器慢性病（肾、骨、髓、脑等“共病”）防治研究，不仅提高了临床疗效，而且在中医“气血理论”、“肾主骨” 理论、“肾藏精”理论传承创新发展方面取得了系统性、原创性贡献。发现“气虚血瘀、肾精亏虚”是骨代谢疾病共同病理基础，表 现为慢性炎症刺激、免疫力低下以及干细胞衰老；创立“先调气血、后补肾精”临床治疗原则，实现治疗思路重大创新；建立"益气化瘀法"“补肾填精法”临床规范化方案和指南，指导解决“一种病吃一类药，多种病吃一堆药”临床棘手问题；率先建立“骨衰老中医表型组学”，“骨衰老”国际标准化分类学；系统阐释“病证结合”疗效规律，实现骨代谢疾病治疗方法重大突破，不仅提高了临床疗效，而且回答了中医药通过抑制慢性炎症、调节免疫微环境功能、调动干细胞增殖与分化延缓骨代谢疾病发生与发展这个关键科学问题。    先后主持国家重点研发计划项目（国家“973”计划项目）、 国家重点基础研究发展计划项目、国家自然科学基金重点项目（3项）、国家自然科学基金重大国际（地区）合作研究项目（2 项）、 国家自然科学基金杰出青年科学基金等科研项目。主持制定骨代谢疾病专家共识及指南 22 项，授权国家发明专利 19 项，开发出中药新药及新制剂11项，获得新药证书2项、临床批件2项； 建立了“骨代谢疾病三级防治体系”和 31 家培训示范基地，成果在全国200多家医疗机构推广，培养了2600多名基层单位医疗骨干；率先建立了50万人骨代谢疾病前瞻性队列并长期随访，提高了我国骨代谢疾病的综合防治水平。在江西、湖南、云南、 贵州、宁夏、甘肃、新疆等地区开展“健康精准扶贫”和“健康乡村 振兴”行动，直接服务百姓 300 余万人次，减少了“因病致贫、因病返贫”的发生，把研究成果写在祖国和人民需要的地方。带领团队荣获上海市五一劳动奖状、工人先锋号和劳模创新工作室，“骨健康服务”团队荣获首批“全国高校黄大年式教师团队”；个人荣获全国先进工作者、全国优秀科技工作者、上海市劳动模范、首届医德风范（骨科）卓越成就奖和上海医学发展杰出贡献奖。    主编、参编专著 28 部，主编了我国第一本“肾精理论”、第一本“肾骨理论”研究专著；主编《中医骨伤科学》《中医骨伤科 学临床研究》《实验骨伤科学》《运动医学》等统编教材。应邀参加国际学术交流或担任大会主席 20 多次，第一和通讯作者共计发表论文628篇，被正面引用13600次；其中在 JBMR、 A&R、Spine、Bone Research 等专业期刊以及 Nature、Cell、 Lancet、BMJ 子刊发表 SCI 收录论文159篇，影响因子大于 5 的116篇，入选美国斯坦福大学发布的 2021 年度“全球前 2%顶 尖科学家”榜单，成为享有国际声誉的骨科专家。    王拥军以第一完成人荣获国家科技进步奖二等奖2项 （2011，2015）、中华医学奖（自然科学类）一等奖（2007）、 中国高等学校科学技术进步奖（自然科学类）一等奖（2013）、 上海市科技进步奖一等奖（2014，2017）、中国中西医结合学 会科学技术奖（基础研究类）一等奖（2010，2014）等 6 项省部级一等奖。《中医骨伤科学临床研究》荣获首届全国教材建设3奖全国优秀教材（高等教育类）二等奖、世界中医药学会联合会 首届中医药国际贡献奖——著作奖一等奖和首批上海高等教育 精品教材。先后成为全国先进工作者、全国优秀科技工作者、国家“973”计划项目首席科学家、国家杰出青年科学基金获得者、长江学者奖励计划特聘教授、首批“万人计划”百千万工程领军人才、国家重点研发计划负责人、中医药传承与创新“百千万”人才 工程—岐黄工程首席科学家、享受国务院政府特殊津贴专家、国家百千万人才工程国家级人选、国家卫生部有突出贡献中青年专 家、中医药传承与创新“百千万”人才工程——岐黄学者、上海市 领军人才、上海市优秀学科带头人、上海市科技精英等。培养的博士获得“全国百篇优秀博士学位论文奖”以及国家优青，21人次获得 Young investigator award 等国际性学术奖。    率先发起并成立中华中医药学会精准医学分会，担任第一届、第二届主任委员，担任中华中医药学会骨伤科分会副主任委员、世界中医药学会联合会抗衰老专业委员会副主任委员、中国康复学会颈椎病专业委员会副主任委员、ASBMR及ORS委员，WHO基本药物与传统医学技术合作委员会；担任Journal of World Chinese Medicine、中医正骨、中国中医骨伤科杂志、中国骨质疏松杂志、环球中医药杂志副主编等；担任国务院学位委员会第八届中医学组召集人，国家科技成果评审专家，教育部、科技部、卫生健康委员会、国家自然科学基金委评审专家，国家医保目录、国家基本药物目录中药评审组副组长。长期推动中医药学科建设，提高了我国中医学整体办学水平和学科建设能力，促进了中医骨伤科学和中医老年病学传承创新发展。