长期从事肺癌发病分子机理研究，在肺癌发生发展、转分化及耐药等方面做出了国际前沿的工作，包括：利用小鼠模型证实肺腺癌向肺鳞癌转分化的存在并揭示其在肺癌耐药中的作用及调控机制；鉴定肺癌治疗相关的重要分子靶标RET融合，推动基础研究向临床应用的转化医学研究；利用双功能同源重组酶体系开创性地在小鼠体内标记支气管肺泡干细胞并证实其在肺损伤修复与再生中的重要作用；揭示小细胞肺癌化疗耐药的代谢重编程机制并提出克服临床小细胞肺癌患者化疗耐药的治疗策略等。在Nature、Cell、Cancer Cell、Nature Genetics、Nature Cancer、J Clin Oncol等期刊发表论文180余篇，被引19000余次，H index 70 (Google scholar)。作为通讯/第一（共同）作者在 Nature、Cell、Cancer Cell、Nature Genetics、Nature Cancer、Annals of Oncology、J Clin Oncol、Annals of Oncology、J Clin Invest、Cell Res、Nature Communications、National Science Review、PNAS等期刊发表论文90余篇。论文多次被Cancer Discovery、J Clin Oncol 和Faculty of 1000 Biology等作为研究亮点点评。