1982年10月，受卫生部委托，由上海市医学会与黑龙江省《医院管理杂志》编辑部联合在沪召开了全国城市医院门急诊管理学术交流会议，会议对《医院急诊室建设方案》征求了意见，这是门急诊部统一管理向急诊科独立建制的开始，也为急诊医学专科分会的成立奠定了基础。1986年10月，在上海召开了首届急诊医学学术会议并正式成立了中华医学会急诊医学分会筹备委员会。1987年5月，中华医学会急诊医学分会正式成立，促进了全国各省市急诊医学分会的成立。1989年，上海市医学会急诊医学专科分会正式成立。
一、主要学术会议、科普活动等
1993年11月，在上海举办由中华医学会急诊医学学会灾害医学专业组、上海市医学会、瑞金医院共同主办的第一次全国灾害医学学术交流会。2002年11月，急诊医学专科分会和危重病专科分会在上海市医学会联合召开年会。2003年7月，由中华医学会急诊医学分会急诊质控组主办、上海市医学会急诊医学专科分会和危重病专科分会、上海市急诊ICU质控中心共同承办了全国急诊ICU质控标准研讨会。2004年10月，由中华医学会急诊医学分会、亚太地区灾害医学学会主办，上海市医学会急诊医学专科分会、《中华急诊医学杂志》、中华急诊网承办了第十次全国急诊医学学术交流会暨第七届亚太地区灾害急诊医学研讨会，参加本次会议的代表有来自12个国家和地区的61名国外急诊、急救、管理领域的专家学者及我国26个省市自治区的400多位代表，这次会议收到论文580篇，其中100多篇进行了专题讲座及大会交流。2006年11月，在瑞金医院急诊医学沙龙成功举办了道路交通伤害防治研讨会。
急诊医学专科分会一直与危重病专科分会联合举办年会，每两年主办一次，其中2011年10月在上海世博中心召开第一届东方急救重症灾害医学大会暨2011上海市急诊与危重病医学分会年会，本市乃至全国500多名代表以及十余位国际著名专家出席了会议，会议设11个专场41个专题报告，还有12篇青年优秀论文得到老专家的点评并获奖，会议期间还穿插了高仿真模拟人与综合急救培训以及上海警航队的直升机现场救援表演，为会议增添了一抹亮色。
二、医学成就
2004年，20多名上海市医学会急诊医学专科分会和危重病专科分会委员参加制定的《上海市急诊科和ICU建设标准》由上海市卫生局颁布下发并在上海市115所医院实施，这是全国第一个急诊科、ICU质量建设标准。2006年，上海市医学会急诊医学专科分会开始在全市范围内逐步开展急诊医学专业发展状况的普查，包括从业人员结构、医院硬件配置、管理模式、急诊医学学科建设。2011年11月，由30多名上海市医学会急诊医学专科分会和危重病专科分会委员、上海市急诊ICU质控中心专家参加修订的第二版《上海市急诊、ICU质控手册》由上海市卫生局颁发。经过2年多时间编写，2016年由30多名上海市医学会急诊医学专科分会和危重病专科分会委员、上海市急诊ICU质控中心专家参与的《上海市急救医疗服务条例》和《上海市医疗机构急诊科建设与管理指南》，分别由市人大通过公布和市卫计委制定印发。
三、学会荣誉
荣获上海市医学会2004年度、2009年～2010年度、2014年～2015年度优秀专科委员会，以及2007年度、2016年度表扬专科委员会。