20世纪60至70年代，上海一批泌尿科医师响应国家计划生育的号召，积极投身输精管结扎、棉酚避孕的研究，推动了我国男性生殖相关生育力调控研究，也为上海男科学的发展培养了专科队伍。1981年8月，由卫生部和国家计生委组办了“全国男科学学习班”，此后各省市相继举办各种类型讲习班和研讨会。1986年《临床男性学杂志》在上海创刊，1995年6月，中华医学会男科学会成立。1996年，上海市医学会男科专科分会正式成立，江鱼教授任主任委员。
一、主要学术会议、科普活动等
分会成立后，每年联合泌尿外科专科分会举办上海泌尿男科学学术年会。20世纪90年代至今，仁济医院江鱼、王益鑫、黄翼然教授先后举办男科培训班与仁济男科论坛，推动中国与上海男科学发展。2001年始，张元芳教授在华山医院每年开设“显微外科技术在泌尿及男科中的应用”研究生班课程。2006年7月，张元芳教授领衔举办上海市男科学术年会。2013年8月，夏术阶与李铮教授在上海市医学会的大力支持下，举办上海国际男性健康论坛，至今已经连续5年，促进上海男科与国际男科学界的学术交流。2016年，夏术阶教授在王一飞教授等亚洲男科同道的大力支持下，亚洲男科学协会在上海进行改选并举行学术大会，夏术阶教授当选为新一届亚洲男科学协会主席。2016年9月在安徽合肥、2017年9月在山东济南举行2届亚洲男科学协会学术年会。
分会积极承办或协办国际与全国学术活动。2002年、2006年、2010年、2014年，协助《亚洲男科学杂志》主编王一飞教授分别在上海、南京、澳大利亚成功举办了4届亚太男科学论坛，其中2009年在南京举办国内首次男性不育显微外科培训班。2014年协助张永莲院士承办第6届国际附睾学术大会，这是中国男科学界举办的世界附睾领域国际学术盛会。
分会积极参与上海市医学会科普宣传活动。自 2001年开始，孙颖浩院士组织开展“前列腺疾病 100问”科普活动,该科普活动集图书、讲座、广播等新媒体形式为一体，取得了非常满意的科普社会效益，荣获 2015年度国家科技进步奖二等奖（国家科普最高奖）。为扩大“世界男性健康日”在中国的影响，2013年10月28日至今，已连续4年在上海开展一系列男性疾病科普宣传和男性健康咨询活动，备受市民欢迎。分会还开展科普演讲比赛与男性健康“百例挑一”比赛，并组建上海男性健康俱乐部与男性健康微信群。同时，上海同道共同编写男科学科普专著《塑造健康好男人》，多角度多举措地向广大上海市民宣讲男性健康，提醒人们重视男性健康，对男科疾病要早期预防、早期诊断、早期治疗。
分会专家积极创办科学杂志与编辑出版男科学专著。仁济医院江鱼教授创办《中国男科学杂志》。中国科学院钱绍祯教授、上海交通大学医学院王一飞教授创办《Asian Journal of Andrology》杂志。AJA杂志是国际著名的男科学杂志，现任主编为王一飞教授、助理主编夏术阶教授。上海计划生育科学研究所创办《生殖与避孕》杂志，现更名为《中华生殖与避孕杂志》。2006年至今，在王益鑫、张元芳教授的组织下，分会专家组织编写《中国男性不育诊疗指南》。2016年，夏术阶、李铮教授组织编写《中国男科疾病诊疗指南》。2017年，夏术阶教授组织国内外同道，主编《郭应禄男科学》（第二版）。
二、医学成就
分会专家在男性生殖与不育、生育力保存、男性性功能障碍、前列腺疾病、男性生殖整形与更年期领域取得显著成就。2001年，张永莲院士与香港中文大学合作，首次发现附睾中存在β-防御素Bin1b具有抗菌功能，研究结果发表在《Science》等国际顶尖期刊，之后进一步发现Bin1b具有启动精子运动的功能，引领了附睾β-防御素研究的热潮。2002年，王翔教授在《Nature》杂志发表论文，报道完整性腺器官冷冻保存后移植成功并恢复生育功能。2004年，夏术阶教授开展铥激光前列腺切除术，并根据激光特点和前列腺解剖生理特征，设计出经尿道剥橘式前列腺切除术，经多中心前瞻性对照研究，被证明安全有效，成果发表于《European Urology》。
2012年，孙颖浩院士牵头完成亚洲最大样本量前列腺癌临床多中心研究，在国际上首次报道了前列腺癌诊疗新靶标，这些研究成果被中国前列腺癌诊疗指南采用，并获得国家科技进步奖一等奖。孙颖浩院士团队在国内率先开展精道镜技术，为男性射精管梗阻性无精或血精患者提供新的诊疗方法。近10年来，专科分会建立中国显微男科培训基地，推动了男性不育的显微外科治疗及显微男科在中国的发展。李铮教授组织多中心合作，建立稀少/单精子冻存等男性生育力保存新技术体系，推动中国男性不育取得重大进展。分会专家最早开展阴茎假体研制，至今我国唯一批准用于临床的可膨胀阴茎假体，在上海研制生产，其安全性与有效性可与国外同类产品媲美。2017年，刘默芳组织施惠娟、李铮团队开展多中心研究，揭示精子鱼精蛋白与男性不育表观遗传新机制，发表在《Cell》杂志。分会专家在男性外生殖器整形、阴茎再造、尿道重建和男性迟发性性腺功能减退症等领域都取得骄人成绩，引领中国男科学的发展。
三、学会荣誉
荣获上海市医学会2014年度优秀专科委员会，以及2015年～2016年度表扬专科委员会。