1980年11月17～22日，在内科专科分会召开年会期间，成立了消化、血液、内分泌、肾病、传染病与寄生虫病五个专科分会。各专科委员会委员均经全体会员民主差额选举产生，首届血液学专科分会由潘瑞彭担任主任委员。
一、主要学术活动
历届上海市医学会血液学专科分会重视学术交流与协作，自20世纪80年代中期起定期举办上海血液学会年会。1983年4月，举办了遗传和血液病关系学术报告会。1984年3月，召开1983年度年会。2000年9月，上海市医学会血液学专科分会年会在上海光大会展中心举行，到会240余人。会上陈竺院士报告的“ATRA诱导APL的基因调控网络”及陈赛娟教授报告的“分子细胞遗传学在白血病中的应用”，介绍了当时实验研究的前沿工作。2002年11月，在上海光大会展中心承办中华医学会血液分会第七次全国血液学学术会议。2008～2010年的年会在会议规模上已经有了较大的提升，每届年会人数达到了300～400人。2011年的年会，还专设了院士论坛，王振义院士和陆道培院士分别就白血病干细胞和造血干细胞移植的演进及启示作了精彩演讲。之后每年一届的年会，组委会都会在会议形式和内容上下功夫，或打开区域之门，邀请国内乃至国际上知名专家将最前沿的进展奉献给参会代表；或为了让中青年专家得到锻炼和优势发挥，在年会中专设中青年专家论文报告会；2013～2015年的年会设置了热点问题争鸣专题、继续教育、优秀论文交流等版块，为更多的青年医生提供了交流和展示的平台。2016年的年会，上海市血液学研究所陈赛娟院士作了 “高危APL治疗的思考和对策” 精彩报告。
分会特别重视临床工作，自成立之后每月举办一次临床疑难病例讨论，由各大医院轮流提供病例和发言，潘瑞彭、丁训杰、王振义、欧阳仁荣、林果为、余润泉、王鸿利等知名专家亲自指导，为培养年轻医师和解决临床问题发挥积极作用，在国内血液界产生积极影响。
二、医学成就
20世纪七八十年代，长征医院在国内率先开展M蛋白分子病的研究。1980年，新华医院在上海开展首例骨髓移植治疗再生障碍性贫血，之后长海医院、仁济医院、华山医院等各大医院相继开展胎肝移植、外周血干细胞移植治疗血液病。1986年，华山医院在国内首次开展缺铁性贫血的流行病学调查。1986年，由瑞金医院牵头，在国际上首次开展维甲酸诱导分化治疗急性早幼粒细胞白血病，取得巨大成功，在国际上确立了该病治疗的“上海方案”。1992年，长海医院、长征医院专家开展“6.25”重大核泄漏事故的抢救，在此期间长征医院进行了国内首例单倍型造血干细胞移植。1992年，长海医院与复旦大学合作开展国际首例基因治疗血友病B临床研究。1997年，瑞金医院在国际上首次报道氧化砷治疗急性早幼粒细胞白血病及其机制。
王振义教授（1994）、曾溢滔教授（1994）、陈赛娟教授（2003）当选中国工程院院士。
陈竺教授（1995）、陈国强教授（2015）当选中国科学院院士。
王振义院士2010年获得国家最高科学技术奖，胡锦涛主席亲自颁奖。
三、学会荣誉
荣获上海市医学会2004年度、2006年度、2009年度、2011年度、2013年度、2016年度优秀专科委员会，以及2008年度、2010年度、2012年度表扬专科委员会。