年度：
上海医学科技奖一等奖
2005年度（第四届）
免疫应答负相调控的细胞机制研究
主要完成单位：第二军医大学基础部
主要完成人员：曹雪涛 张明徽 王全兴 陈涛涌 于益芝
后续获奖情况：
2006年中华医学科技奖一等奖
上海医学科技奖一等奖
2005年度（第四届）
有效提高腹膜透析患者生存率的相关研究
主要完成单位：上海交通大学医学院附属仁济医院
主要完成人员：钱家麒 姚强 林爱武 方炜 庞慧华 林星辉 戴慧莉 倪兆慧 张敏芳
后续获奖情况：
2006年度上海科技进步奖一等奖
2006年中华医学科技奖二等奖
2007年度国家科技进步奖二等奖
上海医学科技奖一等奖
2005年度（第四届）
遗传性内分泌代谢性疾病的基因和临床研究
主要完成单位：上海交通大学医学院附属瑞金医院 中国科学院上海生命科学院 上海交通大学医学院健康科学中心
主要完成人员：宁光 李小英 王卫庆 赵咏桔 宋怀东 崔斌 叶蕾 姜晓华 杨军 顾丽群
后续获奖情况：
2006年度上海科技进步奖一等奖
2006年中华医学科技奖二等奖
2008年度国家科技进步奖二等奖
上海医学科技奖一等奖
2005年度（第四届）
颈动脉切除、重建术的实验与临床研究
主要完成单位：上海交通大学医学院附属第九人民医院
主要完成人员：张志愿 郑家伟 竺涵光 孙坚 张陈平 范新东 叶为民 李军 胡永杰 林国础
上海医学科技奖一等奖
2005年度（第四届）
重症急性胰腺炎的基础和临床研究--病情加重因素及脑功能障碍并发症的研究
主要完成单位：上海交通大学医学院附属瑞金医院
主要完成人员：张圣道 汤耀卿 蒋渝 韩天权 雷若庆 毛恩强 戚大川 陈紫千 孔雷 李磊
后续获奖情况：
2006年度上海科技进步奖二等奖
2006年中华医学科技奖一等奖
上海医学科技奖二等奖
2005年度（第四届）
整合高通量技术平台及计算生物学方法研究重大疾病发生及治疗的分子网络
主要完成单位：上海交通大学医学院附属瑞金医院 中国科学院上海生命科学院 上海交通大学医学院健康科学研究所
主要完成人员：张济 王侃侃 陈竺 陈赛娟 沈志祥 杜艳芝 郑培烝
后续获奖情况：
2006年中华医学科技奖二等奖
2007年度上海科技进步奖一等奖
上海医学科技奖二等奖
2005年度（第四届）
骨关节炎发生发展的病理机制及其相关的防治策略
主要完成单位：上海交通大学医学院附属瑞金医院
主要完成人员：邓廉夫 杨庆铭 柴本甫 王毅 万荣 徐建强 刘志宏
后续获奖情况：
2006年中华医学科技奖三等奖
上海医学科技奖二等奖
2005年度（第四届）
炎症免疫及血流动力学因素在动脉粥样硬化发生中的机制研究
主要完成单位：复旦大学附属中山医院 上海交通大学 复旦大学上海医学院
主要完成人员：葛均波 梁春 孙爱军 邹云增 张红旗 胡凯 丁祖荣
后续获奖情况：
2006年中华医学科技奖二等奖
上海医学科技奖二等奖
2005年度（第四届）
产超广谱β-内酰胺酶肠杆菌科细菌的耐药性及其感染的防治研究
主要完成单位：复旦大学附属华山医院
主要完成人员：朱德妹 熊自忠 汪复 胡付品 张婴元 吴湜 吴培澄
上海医学科技奖二等奖
2005年度（第四届）
慢性乙型病毒性肝炎肝纤维化非创伤性诊断体系的建立及其诊断价值的研究
主要完成单位：上海交通大学医学院附属仁济医院 上海长海医院 复旦大学附属中山医院 南京军区上海肝病研究中心 上海长征医院 上海市普陀区中心医院
主要完成人员：曾民德 陆伦根 孔宪涛 万谟彬 王吉耀 陈成伟 蔡雄
后续获奖情况：
2006年中华医学科技奖三等奖
2010年度上海科技进步奖一等奖
2011年度国家科技进步奖二等奖