年度：
上海医学科技奖一等奖
2006年度（第五届）
喉返神经修复的实验及临床研究
主要完成单位：上海长海医院
主要完成人员：郑宏良 陈世彩 周水淼 黄益灯 张速勤 刘锋 刘菲 朱敏辉 陈东辉 张贤
上海医学科技奖一等奖
2006年度（第五届）
新型室间隔缺损封堵器的研制及临床应用研究
主要完成单位：上海长海医院 上海形状记忆合金有限公司
主要完成人员：秦永文 胡建强 赵仙先 吴弘 龚善石 郑兴 丁继军 李卫平 纪荣明 王尔松
后续获奖情况：
2007年度上海科技进步奖一等奖
上海医学科技奖一等奖
2006年度（第五届）
神经免疫性疾病流行病学及多发性硬化的病理机制研究
主要完成单位：上海交通大学医学院附属瑞金医院 上海交通大学基础医学院 上海交通大学公共卫生学院
主要完成人员：程琦 徐凌云 姜国鑫 陈生弟 王莹 杨燕
上海医学科技奖一等奖
2006年度（第五届）
13C呼气试验方法学研究及相关仪器、试剂国产化与临床应用
主要完成单位：上海交通大学医学院附属仁济医院 北京华亘安邦科技有限公司 复旦大学附属华山医院
主要完成人员：黄钢 于科岐 萧树东 严惟力 孙大裕 吴叔明 刘建军 林祥通 袁济民 朱翠英
后续获奖情况：
2007年中华医学科技奖三等奖
上海医学科技奖一等奖
2006年度（第五届）
糖尿病视网膜病变的发病机理研究及防治
主要完成单位：上海交通大学附属第一人民医院
主要完成人员：许迅 李治平 朱琦 夏欣 郑志 王洵 邹海东 朱冬青 顾青 王宁
后续获奖情况：
2007年度上海科技进步奖一等奖
2008年度国家科技进步奖二等奖
上海医学科技奖二等奖
2006年度（第五届）
肝癌发生、发展密切相关的几类重要分子作用机制研究
主要完成单位：上海东方肝胆外科医院
主要完成人员：卫立辛 王一 吴孟超 范瑞芳 郭献灵 张卫国 王涛
后续获奖情况：
2011年度上海科技进步奖二等奖
上海医学科技奖二等奖
2006年度（第五届）
肝硬化门静脉高压症的发病机制与治疗研究
主要完成单位：上海交通大学医学院附属仁济医院
主要完成人员：吴志勇 罗蒙 邱江锋 刘骅 孙勇伟 徐琳 徐庆
后续获奖情况：
2007年度上海科技进步奖二等奖
上海医学科技奖二等奖
2006年度（第五届）
核苷类似物治疗慢性乙型肝炎的10年临床研究
主要完成单位：上海市静安区中心医院
主要完成人员：姚光弼 计焱焱 朱玫 汪月娥 杨敏燕 徐蓓 唐生杰
上海医学科技奖二等奖
2006年度（第五届）
下肢动脉严重缺血性疾病的实验研究和临床应用
主要完成单位：上海交通大学医学院附属第九人民医院
主要完成人员：蒋米尔 陆民 黄新天 陆信武 黄英 刘晓兵 李维敏
后续获奖情况：
2007年度上海科技进步奖三等奖
2007年中华医学科技奖三等奖
上海医学科技奖二等奖
2006年度（第五届）
急性移植物抗宿主病发病机制及早期诊治的研究
主要完成单位：上海长海医院
主要完成人员：楼国良 居小萍 张晓青 徐斌 李永梅 刘峰
后续获奖情况：
2007年度上海科技进步奖二等奖