年度：
上海医学科技奖一等奖
2012年度（第十一届）
川崎病冠状动脉病变的流行病学、临床处理及预测指标研究
主要完成单位：复旦大学附属儿科医院 上海市儿童医院 上海交通大学医学院附属上海儿童医学中心
主要完成人员：黄国英 刘芳 马晓静 黄敏 黄美容 吴琳 刘晓琴 俞岑妍 谢利剑 时艳艳
后续获奖情况：
2013年度上海科技进步奖二等奖
2013年中华医学科技奖二等奖
上海医学科技奖一等奖
2012年度（第十一届）
分子标记物指导下晚期非小细胞肺癌个体化治疗的应用
主要完成单位：上海市肺科医院
主要完成人员：周彩存 任胜祥 周崧雯 李雪飞 徐建芳 张洁 吕梅君 张玲 苏春霞 邓沁芳
后续获奖情况：
2013年中华医学科技奖二等奖
上海医学科技奖一等奖
2012年度（第十一届）
青光眼视网膜神经保护新策略的研究与应用
主要完成单位：复旦大学附属眼耳鼻喉科医院
主要完成人员：孙兴怀 陈宇虹 徐建江 孔祥梅 洪佳旭 刘婷婷 莫晓芬 陈君毅 吴继红 钱韶红
后续获奖情况：
2013年度上海科技进步奖一等奖
2013年中华医学科技奖二等奖
上海医学科技奖一等奖
2012年度（第十一届）
听神经瘤分子生物学研究和治疗策略
主要完成单位：上海交通大学医学院附属新华医院
主要完成人员：吴皓 黄琦 杨军 张治华 向明亮 汪照炎 吕静荣 贾欢
后续获奖情况：
2014年度上海科技进步奖一等奖
2013年中华医学科技奖三等奖
2018年度国家科技进步奖二等奖
上海医学科技奖一等奖
2012年度（第十一届）
心脏瓣膜病手术新技术与新型人造瓣膜的研究与应用
主要完成单位：上海长海医院 兰州兰飞医疗器械有限公司
主要完成人员：徐志云 韩林 陆方林 王军 韩庆奇 郭鹏海 赵仙先 唐昊 邹良建 宋智钢
后续获奖情况：
2013年度上海科技进步奖二等奖
2018年度国家科技进步奖二等奖
上海医学科技奖二等奖
2012年度（第十一届）
肝癌生物学特性的基础与临床应用研究
主要完成单位：上海东方肝胆外科医院
主要完成人员：丛文铭 苏长青 卫立辛 吴东 殷正丰 冼志红 井莹莹
后续获奖情况：
2013年度上海科技进步奖二等奖
上海医学科技奖二等奖
2012年度（第十一届）
重金属骨毒效应
主要完成单位：复旦大学
主要完成人员：朱国英 金泰廙 陈晓 孙毅 项希桥 钱海雷 邵春林
上海医学科技奖二等奖
2012年度（第十一届）
玻璃体视网膜增生性疾病的基础与临床研究
主要完成单位：上海市第十人民医院 上海市第一人民医院
主要完成人员：王方 徐国彤 于靖 宋正宇 张敬法 汪浩 刘晓强
后续获奖情况：
2014年度上海科技进步奖三等奖
上海医学科技奖二等奖
2012年度（第十一届）
补肾中药调控骨代谢的细胞生物学机制
主要完成单位：上海中医药大学附属龙华医院 上海中医药大学脊柱病研究所
主要完成人员：王拥军 施杞 陈棣 唐德志 卞琴 舒冰 梁倩倩
后续获奖情况：
2015年度国家科技进步奖二等奖
上海医学科技奖二等奖
2012年度（第十一届）
胆管良性狭窄的内镜介入治疗
主要完成单位：上海东方肝胆外科医院
主要完成人员：胡冰 杨甲梅 高道建 吴军 王书智 时之梅 王田田